簡(jiǎn)要描述:Evagreen (20 × in water)是一種用于實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)的DNA 結(jié)合染料。該染料的諸多優(yōu)點(diǎn)使它遠(yuǎn)勝于SYBR Green I。除了有相似的光譜特性,Evagreen有三個(gè)主要特點(diǎn)使它區(qū)別于SYBR Green I 。
產(chǎn)品分類(lèi)
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品牌 | 其他品牌 | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),綜合 |
產(chǎn)品描述
Evagreen 是一種用于實(shí)時(shí)定量PCR(qPCR)的DNA 結(jié)合染料。該染料的諸多優(yōu)點(diǎn)使它遠(yuǎn)勝于SYBR Green I。除了有相似的光譜特性,Evagreen有三個(gè)主要特點(diǎn)使它區(qū)別于SYBR Green I 。
首先,Evagreen對(duì)PCR的抑制性遠(yuǎn)小于SYBR Green I。因此,使用Evagreen進(jìn)行的qPCR實(shí)驗(yàn)可以使用快速PCR步驟。同時(shí),Evagreen在實(shí)驗(yàn)中可以使用較高的濃度,從而獲得遠(yuǎn)強(qiáng)于SYBR Green I擴(kuò)增信號(hào)。較高濃度的Evagreen也消除了“染料重分布"的缺陷,使Evagreen既可用于多重PCR,也可用于高分辨率(高清晰)熔解曲線(xiàn)分析(HRM)。該分析正被越來(lái)越多的用于PCR后的基因分型和異源雙鏈分析。由于SYBR Green I對(duì)PCR的抑制性,從而要求其使用濃度必須很低,因此SYBR Green I無(wú)法解決由低濃度造成的染料重分布問(wèn)題,既不能用于多重PCR也不能用于HRM。同時(shí),染料重分布問(wèn)題也可能影響常規(guī)熔解曲線(xiàn)的可靠性,因?yàn)榈腿埸c(diǎn)的DNA鏈可能由于這種原因而無(wú)法檢測(cè)到。
第二,Evagreen的穩(wěn)定性強(qiáng)。在正常的儲(chǔ)存、操作和PCR過(guò)程中不會(huì)被破壞。在緩沖溶液中的染料可以安全的儲(chǔ)存在室溫或冰箱里,也可以反復(fù)凍融。與之相反,SYBR Green I不穩(wěn)定而且降解后對(duì)PCR抑制性更強(qiáng)。
第三,Evagreen降低了細(xì)胞膜透性,因而比SYBR Green 1更加安全。獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室的測(cè)試結(jié)果顯示,Evagreen既沒(méi)有誘變性也沒(méi)有細(xì)胞毒性。相反,雖然SYBR Green I本身誘變性很弱,但它在細(xì)胞中可能抑制了正常DNA的修復(fù)機(jī)制,使其有誘變?cè)鰪?qiáng)作用??紤]到PCR的廣泛使用,其安全性應(yīng)該足夠重視。
訂購(gòu)信息
產(chǎn)品名稱(chēng) | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
Evagreen (20 × in water) | AN19L032 | 1 mL |
Evagreen (20 × in water) | AN19L033 | 5 mL |
產(chǎn)品參數(shù)
λabs/λem = 500/530 nm (結(jié)合DNA)
λabs = 471 nm (未結(jié)合DNA)
運(yùn)輸與保存
藍(lán)冰運(yùn)輸。4℃短期避光保存,有效期12個(gè)月;-20℃長(zhǎng)期避光保存,有效期24個(gè)月。
使用方法
如下建立實(shí)驗(yàn)體系:(僅供參考)
名 稱(chēng) | 體 積 |
10× 的無(wú)Mg2+聚合酶緩沖液 | 5 µL |
50 mM MgCl2 | 2.5 µL |
2 mM dNTP | 5 µL |
20×Evagreen | 2.5 µL |
Taq DNA polymerase | 1-5 units |
F, R Primers | 各0.1-0.5 µM |
模板 | 適量 |
dH2O | to a final volume of 50 µL |
實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)20× Evagreen
主要試劑
1. Prime
hβ-actin:
forward 5’ -CACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3’
reverse 5’-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3’
2. HS Taq DNA Polymerase: Thermo(EP0612)
3. Glycerlo: Sigma(V900090-500 mL)
4. BSA: Sigma(A7030)
5. 10 mM dNTPs: Takara(4019)
實(shí)驗(yàn)方案
1. 配制2× Evagreen Buffer
2× Evagreen Buffer | ||
組分 | 濃度 | 體積(μL) |
1 M Tris HCl pH8.5 | 50 mM | 5 |
500 mM (NH4)2SO4 | 20 mM | 4 |
50 mM MgCl2 | 7 mM | 14 |
50% glycerol | 2.5% | 5 |
DMSO | 10 % | 10 |
20× Evagreen | 2× | 10 |
10 mM dNTPs | 0.4 mM | 4 |
2 % Tween20 | 0.03 % | 1.5 |
1 mg/mL BSA | 22 ug/mL | 2.2 |
H2O | / | 44.3 |
Total volume | / | 100 |
2. 配制 q-PCR反應(yīng)體系
成分 | 20 μL/體系/管反應(yīng) |
10 μM primers | 1 μL |
模板 | 適量 |
HS Taq DNA 酶 (5 U/μL) | 0.2 μL |
2× Evagreen buffer | 10 μL |
H2O | 定容至20 μL |
【注】:① DNA 模板的添加量通常在 100 ng 以下。因不同種類(lèi)的 DNA模板中含有的靶基因的拷貝數(shù)不同,必要時(shí)可進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)_定合適的 DNA 模板添加量。cDNA作為模板時(shí)的添加量不要超過(guò) PCR 反應(yīng)液總體積的 10%。②引物終濃度一般控制在0.1-0.5 μM范圍內(nèi)。
3. 實(shí)驗(yàn)分組:標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照樣品孔(陽(yáng)性對(duì)照)、檢測(cè)樣品孔、空白對(duì)照孔(陰性對(duì)照)共三組,同時(shí)進(jìn)行檢測(cè),分別進(jìn)行三次平行實(shí)驗(yàn)。
4. 混勻離心、上機(jī)進(jìn)行熒光定量PCR(儀器為Roche:LC96)。
PCR程序:
溫度 | 時(shí)間 | |
Step 1 | 95℃ | 2 min |
Step 2 | 95℃ | 5 sec |
Step 3 | 60℃ | 30 sec |
Step 2~3,重復(fù) 45個(gè)循環(huán) | ||
熔解曲線(xiàn)Tm值 57℃~99℃ |
5. 保存數(shù)據(jù),判斷樣本質(zhì)量:
A.檢測(cè)樣品與標(biāo)準(zhǔn)品之間的Ct值差
B.檢測(cè)樣品與標(biāo)準(zhǔn)品之間的熒光強(qiáng)度差
檢測(cè)結(jié)果需達(dá)到:以上兩組檢測(cè)指標(biāo)無(wú)顯著性差異
注意事項(xiàng)
本產(chǎn)品僅限于科學(xué)實(shí)驗(yàn)研究使用,不得用于臨床診斷、治療等領(lǐng)域。
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